Odpowiedź na krytykę wirusów umysłu
Zarówno osoby religijne, jak i niereligijne są krytyczne wobec teorii memów Dawkina. Niektórzy skrytykowali pomysł, że „Bóg” i „wiara” są wirusami umysłu, sugerując, że jest on daleki od dowodów i danych”, że nieuzasadnione jest wydobywanie pewnych zachowań wyłącznie poprzez memy religijne. Alister McGrath odpowiedział argumentując, że „memy nie mają miejsca w poważnej refleksji naukowej”, lub że idee religijne funkcjonują w sposób, w jaki twierdzi Dawkins.
Choroba psychiczna lub urojenia
Sam Harris porównuje religię do choroby psychicznej, mówiąc, że „pozwala skądinąd normalnym istotom ludzkim zbierać owoce szaleństwa i uważać je za święte”. Według retrospektywnych badań Abrahama, Mojżesza, Jezusa Chrystusa i Apostoła Pawła, mogli oni mieć zaburzenia psychotyczne, które przyczyniły się do inspiracji ich objawień. Stwierdzają, że osoby z takimi zaburzeniami miały monumentalny wpływ na cywilizację.
Badania psychologiczne nad zjawiskiem mistycyzmu wiążą niepokojące aspekty doświadczeń niektórych mistyków z nadużyciami w dzieciństwie. Clifford A. Pickover znalazł dowody, które sugerują, że padaczka płata skroniowego może być powiązana z różnymi tzw. duchowymi lub „z innego świata” doświadczeniami, takimi jak opętania duchowe, które występują w wyniku zmienionej aktywności elektrycznej w mózgu. Carl Sagan, w swojej ostatniej książce The Demon-Haunted World: Science as a Candle in the Dark, przedstawił swoje przekonanie, że cudowne widzenia postaci religijnych i współczesne obserwacje UFO były spowodowane tym samym zaburzeniem psychicznym. Vilayanur S. Ramachandran sugeruje „Możliwe, że wielu wielkich przywódców religijnych miało napady płata skroniowego i to predysponuje ich do posiadania wizji, posiadania mistycznych doświadczeń”. Michael Persinger sztucznie stymulował płaty skroniowe mózgu polem magnetycznym za pomocą urządzenia, które nazwał „hełmem Boga” i był w stanie sztucznie wywołać doświadczenia religijne wraz z doświadczeniami bliskimi śmierci i obserwacjami duchów. Według Johna Bradshawa „Niektóre formy guzów płata skroniowego lub epilepsji są związane z ekstremalną religijnością.” W jego badaniach ostatnie obrazowanie mózgu osób religijnych modlących się lub medytujących wykazuje identyczną aktywność w odpowiedniej ludzkiej części mózgu, którą Ramachandran nazywa God-spots.
Psilocybina z grzybów wpływa na regiony mózgu, w tym na układ serotoninergiczny, który generuje poczucie silnego znaczenia religijnego, jedności i ekstazy. Pewne rytuały fizyczne mogą generować podobne uczucia.
W książce Why People Believe Weird Things Michael Shermer teoretyzuje, że rodząca się ludzkość narzuciła wymyślone wyjaśnienia i dziwaczne rytuały dla zjawisk naturalnych, których nie rozumiała i nie mogła zrozumieć. Teoria ta jest podobna do argumentów, które Daniel Dennett napisał w Breaking the Spell, jednak Shermer idzie dalej, stwierdzając, że osobliwe i czasami przerażające rytuały religijne są tylko jedną z wielu form dziwnych zwyczajów, które przetrwały do dziś.